Bắt đầu ngay sau sự ra đi của Aerith, nàng gặp gỡ linh hồn những nhân vật đã rời bỏ nhân thế trong Final Fantasy VII, bao gồm Jessie, Biggs và Wedge, Giáo sư Hojo, và cả người bạn trai cũ, Zack Fair. Một vài linh hồn được Aerith an ủi và giúp họ siêu thoát, trong khi số còn lại vẫn còn vương vấn việc đã làm lúc sinh thời nên nàng không thể làm gì được.

Cứ sau mỗi cuộc gặp gỡ, Aerith dần hiểu ra triết lý dựa trên mối quan hệ của bản thân với những người họ, và bản chất thật sự của sinh mệnh.